염색질 재배치 | EpiDyne® Chromatin Remodeling | 고마바이오텍

특징

• DNA와 히스톤단백질의 결합으로 이루어진 뉴클레오좀 및 크로마틴은 전사인자의 접근을 조절함으로써 유전자 발현을 조절합니다.  비정상적인 뉴클레오좀 조직은 유전자 발현, DNA 복구, 세포분화 등을 심각하게 방해할 수 있으며, 암, 염증, 자가면역, 정신 분열증, 심혈관 질환 및 지적장애 등의 human disorder와 관련이 있습니다.  모든 암의 20%는 ATP 의존성 염색질 리모델링 복합체 SWI/SNF 계열의 subunit에 돌연변이를 갖고 있습니다. 이들 효소 복합체는 Histone octamer 주변의 DNA를 펌핑하여  nucleosome이 미끄러지게 만듬으로써, local genome 접근을 조절합니다. 따라서 염색질 리모델링 enzyme은 치료제 개발의 타겟이 될 수 있습니다. 
• EpiDyne 제품군은 염색질 재배치를 모니터링 하기 위한 nucleosome과 substrate 를 제공합니다. 
  
• Histone octamer에는 Cy5가, DNA에는 Cy3가 라벨링되어 있으며, 이 구조가 SWI/SNF ATPase등의 리모델링을 유도하는 효소와 반응하게 될때  재배치가 진행되면서 Cy5가 소실되어 FRET이 감소하는 것을 측정함으로써, 염색질 재배치 여부를 확인할 수 있습니다. 
• 다음과 같은 형식의 chromatin remodeling 분석방법에 이용됩니다.
  - FRET
  - Radiometric DAM methyltransferase assays
  - Restriction enzyme accessibility

적용 

• Inhibitor screening and development
  
• Structure-Activity Relationship assays
• Biochemical profiling of ATPase family proteins

SWI/SNF 리모델링 복합체

SWI/SNF 리모델링 복합체는 ATP 가수분해를 통하여 얻은 에너지를 이용하여 뉴클레오솜의 구조를 변화시키고 많은 유전자들의 발현을 조절합니다. SWI/SNF subunit의 반복적인 체세포 돌연변이는 종양형성을 유발합니다. 돌연변이 리모델링 단백질이 ATPase 활성을 손상시키면 암세포만 사멸되므로 치료제 타겟으로 각광받고 있습니다. 

SWI/SNF subunit의 mutation별 cancer 타입 

종류

EpiDyne® Chromatin Remodeling Enzymes 

EpiDyne® Chromatin Remodeling Substrates